Одной из задач Центра является создание здоровьесберегающей среды и охрана здоровья обучащихся. Для создания оптимальных условий охраны здоровья обучающихся и соблюдения санитарного законодательства СанПиН 2.4.2.2821-10 «Санитарно-эпидемиологические требования к условиям и организации обучения в общеобразовательных учреждениях», а так же улучшению условий труда в Центра проводится ряд мероприятий: 

- определение оптимальной учебной нагрузки, режима учебных занятий и продолжительность каникул; 

- профилактика несчастных случаев с обучающимися во время пребывания в Центре; 

- проведение санитарно-противоэпидемических и профилактических мероприятий; 

- пропаганда и обучение навыкам здорового образа жизни, требованиям охраны труда.